Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UrgcpQ5NCI0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UrgcpQ5NCI0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
UrgcpQ5NCI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms