Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam183bQ5NC57 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam183bQ5NC57 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam183bQ5NC57 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam183bQ5NC57 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam183bQ5NC57 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam183bQ5NC57 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam183bQ5NC57 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam183bQ5NC57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms