Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
1810065E05RikQ5NC41 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1810065E05RikQ5NC41 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1810065E05RikQ5NC41 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1810065E05RikQ5NC41 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
1810065E05RikQ5NC41 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1810065E05RikQ5NC41 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms