Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clhc1Q5M6W3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clhc1Q5M6W3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clhc1Q5M6W3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clhc1Q5M6W3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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