Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Zc3h12aQ5D1E7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12aQ5D1E7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zc3h12aQ5D1E7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zc3h12aQ5D1E7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12aQ5D1E7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12aQ5D1E7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms