Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spsb3Q571F5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spsb3Q571F5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms