Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WhammQ571B6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WhammQ571B6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WhammQ571B6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WhammQ571B6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WhammQ571B6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WhammQ571B6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
WhammQ571B6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
WhammQ571B6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
WhammQ571B6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms