Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhox3aQ4TU90 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox3aQ4TU90 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3aQ4TU90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox3aQ4TU90 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3aQ4TU90 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms