Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc3lQ4KL14 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc3lQ4KL14 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3lQ4KL14 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc3lQ4KL14 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc3lQ4KL14 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms