Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam220aQ3ZN08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam220aQ3ZN08 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Fam220aQ3ZN08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Fam220aQ3ZN08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam220aQ3ZN08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Fam220aQ3ZN08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam220aQ3ZN08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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