Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc9a2Q3ZAS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc9a2Q3ZAS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc9a2Q3ZAS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc9a2Q3ZAS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms