Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs2Q3V3Q7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacs2Q3V3Q7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs2Q3V3Q7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs2Q3V3Q7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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