Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm6Q3UZD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm6Q3UZD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdm6Q3UZD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prdm6Q3UZD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms