Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3l2Q3UXB0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mbd3l2Q3UXB0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3l2Q3UXB0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms