Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ankrd13cQ3UX43 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ankrd13cQ3UX43 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ankrd13cQ3UX43 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ankrd13cQ3UX43 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ankrd13cQ3UX43 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms