Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga4Q3UW12 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga4Q3UW12 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnga4Q3UW12 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms