Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-Eb2Q3UUV9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-Eb2Q3UUV9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms