Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtl4Q3URY0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl4Q3URY0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms