Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5460Q3UQ97 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5460Q3UQ97 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5460Q3UQ97 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm5460Q3UQ97 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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