Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc33Q3ULW6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc33Q3ULW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc33Q3ULW6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms