Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin1rt1Q3ULQ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pin1rt1Q3ULQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pin1rt1Q3ULQ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pin1rt1Q3ULQ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms