Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Babam1Q3UI43 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Babam1Q3UI43 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Babam1Q3UI43 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Babam1Q3UI43 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms