Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-3Q3UHX8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-3Q3UHX8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-3Q3UHX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx6-3Q3UHX8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkx6-3Q3UHX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nkx6-3Q3UHX8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nkx6-3Q3UHX8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkx6-3Q3UHX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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