Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccser2Q3UHI0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccser2Q3UHI0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms