Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zswim8Q3UHH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zswim8Q3UHH1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zswim8Q3UHH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zswim8Q3UHH1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zswim8Q3UHH1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zswim8Q3UHH1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms