Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn7l3bQ3UD01 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn7l3bQ3UD01 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms