Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtpbp6Q3U6U5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtpbp6Q3U6U5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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