Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U6N9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U6N9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U6N9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U6N9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U6N9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U6N9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3U6N9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3U6N9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U6N9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U6N9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U6N9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U6N9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U6N9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U6N9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms