Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4N7

Igflr1, IGF-like family receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igflr1Q3U4N7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Igflr1Q3U4N7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Igflr1Q3U4N7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Igflr1Q3U4N7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Igflr1Q3U4N7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Igflr1Q3U4N7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Igflr1Q3U4N7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Igflr1Q3U4N7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms