Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctu2Q3U308 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ctu2Q3U308 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctu2Q3U308 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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