Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
March9Q3TZ87 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
March9Q3TZ87 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
March9Q3TZ87 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
March9Q3TZ87 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
March9Q3TZ87 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms