Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf3c3Q3TMP1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf3c3Q3TMP1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms