Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc10Q3TLI0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trappc10Q3TLI0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc10Q3TLI0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc10Q3TLI0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc10Q3TLI0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms