Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RubcnlQ3TD16 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RubcnlQ3TD16 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RubcnlQ3TD16 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RubcnlQ3TD16 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RubcnlQ3TD16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms