Protein–RNA interactions for Protein: Q32NZ6

Tmc5, Transmembrane channel-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc5Q32NZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmc5Q32NZ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmc5Q32NZ6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmc5Q32NZ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmc5Q32NZ6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmc5Q32NZ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms