Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M3Q31093 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms