Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930480E11RikQ0VG34 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930480E11RikQ0VG34 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930480E11RikQ0VG34 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms