Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmntd2Q0VET5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmntd2Q0VET5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmntd2Q0VET5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmntd2Q0VET5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmntd2Q0VET5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmntd2Q0VET5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmntd2Q0VET5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmntd2Q0VET5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms