Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rundc1Q0VDN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rundc1Q0VDN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rundc1Q0VDN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rundc1Q0VDN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
Rundc1Q0VDN7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rundc1Q0VDN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rundc1Q0VDN7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rundc1Q0VDN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms