Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
StumQ0VBF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
StumQ0VBF8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms