Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Lrriq1Q0P5X1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Lrriq1Q0P5X1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Lrriq1Q0P5X1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lrriq1Q0P5X1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Lrriq1Q0P5X1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Lrriq1Q0P5X1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Lrriq1Q0P5X1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms