Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrstQ06666 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SrstQ06666 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrstQ06666 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SrstQ06666 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SrstQ06666 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrstQ06666 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrstQ06666 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SrstQ06666 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms