Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Prrx2Q06348 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prrx2Q06348 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrx2Q06348 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrx2Q06348 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms