Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep1Q03172 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hivep1Q03172 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hivep1Q03172 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hivep1Q03172 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms