Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha4Q03137 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Epha4Q03137 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha4Q03137 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms