Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp1Q01514 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gbp1Q01514 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbp1Q01514 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms