Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoa1Q00623 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoa1Q00623 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoa1Q00623 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoa1Q00623 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoa1Q00623 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Apoa1Q00623 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apoa1Q00623 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoa1Q00623 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms