Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
AlkP97793 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
AlkP97793 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
AlkP97793 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
AlkP97793 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
AlkP97793 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
AlkP97793 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
AlkP97793 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
AlkP97793 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
AlkP97793 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
AlkP97793 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
AlkP97793 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
AlkP97793 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
AlkP97793 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
AlkP97793 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
AlkP97793 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
AlkP97793 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
AlkP97793 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
AlkP97793 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
AlkP97793 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
AlkP97793 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
AlkP97793 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
AlkP97793 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
AlkP97793 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
AlkP97793 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
AlkP97793 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
AlkP97793 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
AlkP97793 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
AlkP97793 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
AlkP97793 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
AlkP97793 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
AlkP97793 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
AlkP97793 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
AlkP97793 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
AlkP97793 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
AlkP97793 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
AlkP97793 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
AlkP97793 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
AlkP97793 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
AlkP97793 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
AlkP97793 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
AlkP97793 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
AlkP97793 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
AlkP97793 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
AlkP97793 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
AlkP97793 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
AlkP97793 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
AlkP97793 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
AlkP97793 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
AlkP97793 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
AlkP97793 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
AlkP97793 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
AlkP97793 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
AlkP97793 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
AlkP97793 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AlkP97793 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AlkP97793 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
AlkP97793 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
AlkP97793 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
AlkP97793 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
AlkP97793 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
AlkP97793 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
AlkP97793 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
AlkP97793 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
AlkP97793 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
AlkP97793 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
AlkP97793 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
AlkP97793 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
AlkP97793 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
AlkP97793 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
AlkP97793 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
AlkP97793 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
AlkP97793 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AlkP97793 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AlkP97793 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AlkP97793 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
AlkP97793 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
AlkP97793 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
AlkP97793 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
AlkP97793 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
AlkP97793 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
AlkP97793 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
AlkP97793 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
AlkP97793 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
AlkP97793 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
AlkP97793 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
AlkP97793 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
AlkP97793 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
AlkP97793 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
AlkP97793 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
AlkP97793 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
AlkP97793 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
AlkP97793 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
AlkP97793 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
AlkP97793 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
AlkP97793 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
AlkP97793 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AlkP97793 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
AlkP97793 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
AlkP97793 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms