Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bop1P97452 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bop1P97452 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bop1P97452 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bop1P97452 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bop1P97452 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bop1P97452 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bop1P97452 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bop1P97452 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bop1P97452 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bop1P97452 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bop1P97452 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bop1P97452 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms