Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps45P97390 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps45P97390 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps45P97390 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps45P97390 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps45P97390 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps45P97390 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps45P97390 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps45P97390 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps45P97390 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps45P97390 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps45P97390 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps45P97390 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps45P97390 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms